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O vínculo contratual de Nascimento com o Vitoria terminava, como efectivamente terminou, em 31 de Julho de 1989, tendo o jogador recusado por varias vezes renovar o contrato que o ligava ao clube, o que motivou um profundo mal-estar no presidente da Direcção dado que alem de estarmos perante um jogador nuclear da equipa, Nascimento exercia também o cargo de capitão. O certo é que Nascimento abandonou o Vitoria e assinou com o FC Porto.
Pimenta Machado considerou uma traição ao Vitoria e nunca lhe perdoou essa conduta. De tal modo, que segundo se diz, o nome dele foi sempre o entrave à entrada de Manuel Cajuda no Vitoria. Já que o técnico algarvio não prescindia do Nascimento como seu treinador adjunto, e por seu turno, o Presidente do Vitoria, não admitia o regresso de Nascimento aos quadros do Vitoria.
Certo é que Nascimento foi contratado pelo FC Porto para a temporada de 1989/90, na equipa liderada pelo treinador Artur Jorge. Acontece que Nascimento nunca foi titular na equipa portista, aparecendo apenas esporadicamente no onze principal. Ao todo, contabilizou 13 presenças em jogos oficiais, e anotou um golo na prova. De qualquer forma, sagrou-se campeão nacional pelos azuis e brancos na temporada de 1989/90.
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(No FC Porto na época de 1989/90)
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(Equipa do FC Porto na temporada de 1989/90)
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Acabaria a época na lista de dispensados do FC Porto, e consequentemente foi cedido ao Tirsense, treinado pelo Professor Neca. Na equipa de Santo Tirso, Nascimento foi titularíssimo, participando em todos os jogos oficias da competição, na qual apontou 5 golos. Na equipa do Tirsense encontrou 2 seus antigos companheiros no Vitoria de Guimarães, concretamente, os avançados Silvinho e Kipulo. Contudo, a equipa do Tirsense acabaria por se classificar na 16ª posição do Campeonato Nacional da 1ª Divisão da temporada de 1990/91, sendo, por via disso, relegada à 2ª Divisão de Honra.
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Nascimento contava já com 31 anos de idade, continuando a jogar na equipa do Tirsense que apontava como principal objectivo para a temporada de 1991/92 o regresso à 1ª Liga. E conseguiu. Sob os comandos de Rodolfo Reis, o Tirsense ocuparia a ultima vaga que permitia o acesso à 1ª Divisão, terminado a época na 3ª posição da tabela classificativa do campeonato da 2ª Divisão de Honra. Porem, Nascimento já não possuía o fulgor de outras épocas e por esse motivo apenas foi utilizado em 7 ocasiões. A título de curiosidade, destaque-se que nesta equipa do Tirsense de 1991/92, alem de Nascimento, constava do plantel, alem de Silvinho, o guarda-redes Vítor Pontes, antigos companheiros do tempo do Vitoria de Guimarães.
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(No FC Tirsense na época de 1990/91)
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Nascimento não permaneceria ao serviço do Tirsense, continuando, todavia a jogar futebol profissional, desta feita rumou ao Amora, treinado pelo Professor Rui Lopes, que acabava de ascender à 2ª Divisão de Honra, depois de vencer a Zona Sul da 2ª Divisão “B”.
Individualmente, Nascimento manteve-se em plano descendente na carreira, já que apenas foi utilizado pelo Amora na época de 1992/93 por 5 vezes. O Amora acabaria por terminar a prova classificado na penúltima posição o que motivou o regresso à 2ª Divisão “B”. O facto mais assim assinalável, foi a chegada do Amora aos quartos de final da Taça de Portugal, onde acabou por encontrar o SL Benfica, o primeiro clube de Nascimento em Portugal. O Amora, acabaria porem, eliminado pelo SL Benfica em pleno Estádio da Luz, por uma copiosa derrota por 5-0.
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Terminada a carreira de futebolista profissional, Nascimento enveredou pela carreira de técnico, nomeadamente como adjunto do treinador Manuel Cajuda. Rui Nascimento, como hoje é conhecido, foi durante 14 anos o fiel escudeiro daquele que presentemente é o actual técnico do Vitoria Sport Clube.
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Com Manuel Cajuda, o Rui Nascimento foi seu adjunto entre 1994 e 1997, no SP. Braga, entre 1997 e 1999 no Belenenses, entre 1999 e 2002 estiveram de novo juntos no SP Braga. Na época 2002/03 constituíram a equipa técnica da UD Leiria, clube da cidade natal de Rui Nascimento e entre 2003 e 2005 estiveram ao serviço do CS Marítimo. Por fim, formaram a dupla técnica do Beira Mar em 2004/05 e na Naval 1º de Maio em 2005/06.
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(Adjunto de Cajuda no SC Braga)
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(Plantel do SC Braga em 1996/97)
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(Plantel do SC Braga em 1999/00)
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(Ao lado de Manuel Cajuda)
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(Juntamente com Manuel Cajuda no dia da apresentação no Beira Mar).
Entretanto, com a ida do treinador Manuel Cajuda para o Zamalek, Rui Nascimento emancipou-se e treinou, como técnico principal, o CD Pinhalnovense, que disputou a Série D da 2ª Divisão “B” na época de 2006/07. Todavia, na proxima época de 2007/08 vai reeditar a dupla técnica com Manuel Cajuda no Vitoria de Guimarães, refletindo assim o regresso de Rui Nascimento à cidade berço onde atingiu o maior sucesso na sua carreira de futebolista profissional.
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(Rui Nascimento como treinador principal no CD Pinhalnovense)
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